自動裝盒機進料一般分為三個入口：說明書入口、藥瓶入口和機包盒入口。從機包盒進料到z后包裝成型的整個過程大致可以分成四個階段：由一個導軌卡位將紙盒固定并用一個推板打開紙盒，同時會有兩個可向前移動的卡位從下面升起，從前后方向卡住紙盒的側面，使盒子打開成直角并前移到裝填區域。

在裝填區域填裝后，自動裝盒機的機構會將耳朵折進左右的導軌中，然后再進行合蓋動作。合蓋前機構會先彎折紙盒的插舌，然后有一推板推動盒蓋彎折，使插舌c進盒子中并使鎖扣扣緊。合蓋動作是個關鍵性的動作，完成的好壞與紙盒的結構和自動裝盒機調節的準確程度有很大關系。